你是不是也曾在朋友圈看到別人發(fā)的進化樹圖,精致又專業(yè)?那種從物種起源到分支演化的線條,像一幅科學藝術(shù)品。很多人問:“Mega怎么畫進化樹?”今天我就來手把手教你——不靠運氣,只靠技巧。
首先,別慌!Mega(即MEGA X)是分子進化遺傳學分析軟件,雖然名字聽起來高冷,但其實超好上手。我第一次用它時,也是從“這玩意兒怎么打開”開始的。別擔心,只要準備好你的數(shù)據(jù),比如DNA序列文件(FASTA格式),就能開工啦。
舉個真實案例:我去年幫一位朋友做植物進化研究,他收集了5種苔蘚的rbcL基因序列。我用Mega導入后,先選“Distance Methods”里的NeighborJoining法,設(shè)置參數(shù)為Kimura 2parameter模型,再點擊“Compute”,短短幾分鐘,一條清晰的進化樹就出來了!
重點來了:如何讓進化樹更美?很多人只關(guān)注結(jié)果,卻忽略了細節(jié)。我在小紅書分享過一個“三步美化法”:
調(diào)整分支顏色和粗細:在“Tree View”里,你可以給不同類群染色,比如綠色代表蕨類,藍色代表苔蘚,視覺沖擊力瞬間拉滿。
添加標簽和注釋:右鍵節(jié)點,選擇“Label”加名稱,再用“Text Tool”寫上“推測分化時間”或“地理分布”,學術(shù)感立馬有了。
導出高清圖片:記得選PNG格式,分辨率設(shè)成300dpi,朋友圈發(fā)出來,朋友都以為你是生物系博士!
當然,新手常犯的錯誤我也踩過:比如沒對齊序列、用了錯誤的模型、或者直接用默認參數(shù)。后來我專門整理了一份《Mega避坑指南》,現(xiàn)在還放在我的公眾號里,想看的朋友可以私信我發(fā)你~
最后送一句真心話:畫進化樹不是為了炫技,而是幫你講清楚“這些物種到底從哪里來”。當你看到自己親手做出的樹,像一棵生命之根扎進時間深處,那種成就感,真的比發(fā)朋友圈還爽。
所以,別等了,下載Mega,從今天開始,讓你的科研成果也能被看見!???

